Οι εκδόσεις ΕΝΝΟΙΑ ιδρύθηκαν το 1996 στην Αθήνα με αρχικό αντικείμενο εργασιών την έκδοση σχολικών βοηθημάτων κλασικής παιδείας.

Το 2004 οι εκδόσεις εισήλθαν στον χώρο των πανεπιστημιακών συγγραμμάτων με την έκδοση δύο τόμων των Απόκρυφων Κειμένων της Παλαιάς Διαθήκης του αειμνήστου Καθηγητή Α­γουρίδη Σάββα.

Σήμερα η εταιρεία λειτουργεί υπό τη διεύθυνση του Μπαλιάτσα Δημήτρη με βασικό πλέον αντικείμενο την έκδοση πανεπιστημιακών συγγραμμάτων. Ο ίδιος δε ο ιδιοκτήτης των εκδόσεων, ο Μπαλιάτσας Δημήτρης, υπηρέτησε (2009-2016) το επιστημονικό σύγγραμμα από τη θέση του προέδρου του Συλλόγου Εκδοτών Επιστημονικών Βιβλίων (Σ.Ε.Ε.ΒΙ.).